Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms