Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms