Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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