Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms