Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms