Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms