Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms