Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms