Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms