Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms