Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-5Q9HDB9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms