Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms