Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms