Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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