Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms