Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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