Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms