Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTRT3Q9BYD9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms