Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC4A5Q9BY07 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms