Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF17Q9BXT8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms