Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms