Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms