Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CMTM3Q96MX0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms