Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL15Q96M94 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms