Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms