Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00526Q96FQ7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms