Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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