Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms