Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDAQ92838 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDAQ92838 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms