Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRUQ92729 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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