Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms