Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3BQ92485 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms