Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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