Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms