Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms