Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms