Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms