Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms