Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms