Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms