Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225Q6GV28 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms