Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms