Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms