Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRPF38BQ5VTL8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRPF38BQ5VTL8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms