Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms