Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZK1Q5T2W1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms