Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms