Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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