Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM187BQ17R55 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms