Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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